1. 协商解决：当机房托管合同纠纷发生时，双方当事人应本着互谅、互让的精神，自愿协商解决。这种解决纠纷的方式无需任何第三人介入，有利于及时解决纠纷，也有利于维护企业间长期建立起来的协作关系。

2. 调解解决：如果双方当事人无法协商一致，可以请协议条款约定的单位或人员居中进行调解。这种调解不同于仲裁程序和诉讼程序中以调解方式结案的调解。调解过程中，调解方将听取双方当事人的陈述，分析纠纷原因，提出解决方案，促使双方达成调解协议。

3. 仲裁解决：合同发生纠纷后，如果双方当事人不愿意协商、调解或协商、调解不成的，可以仲裁或诉讼。仲裁是指合同双方当事人在争议发生后，根据事先约定的仲裁条款或事后达成的仲裁协议，将纠纷提交给仲裁机构进行裁决的争议解决方式。在仲裁过程中，仲裁员将对纠纷进行审理并作出裁决，具有法律效力。

4. 诉讼解决：当机房托管合同纠纷无法通过协商、调解和仲裁解决时，双方当事人可以向人民法院提起诉讼。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼。在诉讼过程中，双方当事人需提供证据，人民法院将根据事实和法律作出判决。

总之，解决机房托管合同纠纷的方法包括协商、调解、仲裁和诉讼。在具体操作中，应根据实际情况选择合适的解决方式，争取尽快解决纠纷，恢复正常运营。